O tratamento dado ao acervo do MIS é o museológico. Está organizado em sete setores, separados por tipologias: sonoro, textual, audiovisual, iconográfico, partitura, tridimensional e bibliográfico.
O Acervo é formado com 42 coleções particulares de grandes personalidades da nossa cultura. Com mais de 650 mil itens, documentos nos mais variados suportes: fotografias em papel, negativos em vidro, negativos estereoscópicos, cartazes, gravuras, discos, filmes, fitas de vídeo e de áudio (formatos diversos), documentos textuais, partituras e objetos tridimensionais (instrumentos musicais, indumentária, medalhas, troféus, etc.). Este acervo constitui uma significativa parcela da memória carioca. Foi doado ou adquirido de personalidades relacionadas aos diversos setores culturais, com ênfase para a música popular brasileira.
Sede Lapa
Na sede Lapa encontram-se o acervo Tridimensional, Sonoro, Textual, Partitura, Bibliográfico e Audiovisual.
Acervo Tridimensional
São os objetos em três dimensões (comprimento, largura e altura). Deste acervo fazem parte, por exemplo, troféus, medalhas, instrumentos musicais, utensílios pessoais.
Acervo Sonoro
Como o nome já indica, são os dispositivos que emitem som, analógicos ou digitais, como fita cassete e rolo, disco de acetato sobre alumínio, acetato sobre papel, cera e vinil, CDs, dentre outros aparelhos.
Acervo Textual
É composto dos documentos manuscritos, datilografados ou impressos, como scripts e roteiros de programas, correspondências, documentos contábeis, documentos pessoais, convites, textos legais (contratos empresa, gravadoras etc.); produção intelectual, tais como textos, entrevistas, recortes de jornais, e outros.
Partitura
São as notações musicais manuscritas ou impressas. O setor possui capa de partitura e partituras que somam 84.997 itens. Sendo 35.459 partituras manuscritas e 48.636 impressas.
Acervo Bibliográfico
Entre revistas, folhetos, livros, periódicos e referências e muitos outros itens.
Acervo Audiovisual
São instrumentos que transmitem mensagem por meio de som e imagens (fixas ou com movimento), em sincronia. Os objetos se apresentam em diversos formatos, como arquivo digital (DVD/HD), fita de vídeo (BETACAM/ DVCAM/MINI-DV/ U-MATIC/ VHS/ S-VHS), películas cinematográficas em 16 e 35 mm, além de outros formatos.
Sede Praça XV
Na sede Praça XV, encontra-se o acervo Iconográfico.
Acervo Iconográfico
São documentos bidimensionais, como fotografias em papel e estereoscópicas em vidro, negativos em vidro, diapositivos, cartazes, desenhos, serigrafias e gravuras, dentre outros.